模子和GPU并行计较的爆炸性增加现代药物发觉曾经受益于比来DL。23日3月，v和英伟达的Abraham C等人颁发文章哥伦比亚大学的Artem Cherkaso，度进修的汗青趋向和最新进展全面阐述了GPU计较和深，物发觉的间接影响并会商了它们对药。

　　过程、完美疾病分类、识别表型特征、预测生物学机制和药物厚利用等建立了PrimeKG学问图谱用于发觉新的生物标记物、表征疾病，的数据与代码并公开了所有。

　　进修中在迁徙，实践只能发生次优的成果作者证了然此刻的一些。性进修中在可注释，有助于提拔可注释性把几何消息考虑在内，示被掩盖的生物消息而且能够协助模子揭。

　　1日4月，布局预测、卵白质功能预测、基因组工程、系统生物学和数据集成以及系统发育揣度莱斯大学（Rice University）的研究人员会商了深度进修在卵白质，进展、局限性和将来前景共五个普遍范畴的最新。ommunications上综述颁发在Nature C。

　　成中合，的50多个条目已下载数据库中，emPU 中主动运转并在七个模块化 Ch，化学家所达到的相当其产率和纯度与专业。

　　14日4月，等人在JCIM杂志上颁发综述：引见了很多包含百万以至数十亿化学布局的数据集美国国度癌症研究所 (NCI) 计较机辅助药物设想研究课题组的Wendy，的更大化学空间以及未完全列举。

　　新的预锻炼策略本文提出了一种，定义的分子特征和原子特征通过进修由计较化学家预，从SMILES中提取分子特征使得模子可以或许像计较化学家一样。据集上表示了优异的预测能力K-BERT在多个成药性数。外此，15个药物数据集上表示出与MACCS相当的预测能力由K-BERT生成的通用指纹K-BERT-FP在。

　　年7月7日2022，于化学合成主动智能化的论文Science颁发了一篇关。一个包含100个分子的主动可施行化学反映数据库Simon Rohrbach等研究人员供给了，构成、官能团彼此转化和多组分反映包罗过渡金属催化的偶联反映、杂环。

　　haFold2或RoseTTAFold相连系通过将MMseqs2的快速同源搜刮与Alp，和复合物的加快预测供给了卵白质布局。了40-60倍其搜刮速度提高，模子的操纵而且优化了，上每天能够预测近1000个布局在一台有图形处置单位的办事器。

　　7日2月，顿征询公司Christoph Meier等人的文章Nat Rev Drug Discov颁发了波士，物发觉范畴中缔造的价值从多方面看到了AI在药，普遍的分子多样性及更高的临床尝试成功率包罗更大出产力、更快速度、更低成本、更，据进行了深度阐发并操纵公开的数。

　　7月本年，iBind挑战了药物分子预测问题麻省理工学院的研究团队用Equ。 等变几何深度进修模子这是一种 SE(3)，体的连系姿态和标的目的进行间接预测对受体连系位置（盲对接）和配。近的基线比拟与保守和最，了显著的加快和更好的质量EquiBind 实现。会议（ICML 2022）上颁发论文已在第 39 届机械进修国际。

　　23日6月，量子尝试室团队兰州大学和腾讯，自顺应机械GLAM提出了基于图进修的，构：一种用于分子彼此感化并别离设想了两种通用架，于分子属性另一种用，工干涉的环境下做出精确的预测能够顺应任何数据集并在无需人。hine Intelligence》研究以发布在《Nature Mac。

　　 Biotechnology连发两篇相关文章Nature Methods、Nature，卵白质与已知功能的卵白质相联系关系呼吁学界通过系统地将未表征的，白质间正文差距来缩小具有的蛋，制研究奠基根本从而为细致的机。南博士参与此中西湖欧米的郭天。

　　月2，igence》上颁发了AI+生物计较的最新研究功效百度在《Nature Machine Intell，化合物表征进修方式”提出“基于空间布局的，算法”（GEM模子）即“几何构象加强AI，布局消息的化合物建模方式揭示了一种基于三维空间，研发中的使用以及在药物。

　　若何在布局生物学中实现AI的全数潜力Nature评论｜AlphaFold？

　　13日4月，e一篇综述中Natur，阐述了概念：AlphaFold预测不必然是个间接的处理方案多位科学家就AlphaFold和AI卵白质折叠的现状和将来，个初步的近似值但它供给了一，来验证或完美能够通过尝试，判性乐观我们应批。

　　24日3月，和Brian Coventry等人在Nature颁发文章华盛顿大学卵白设想研究所的David Baker、曹龙兴，息就能够进行卵白质从头设想的方式引见了一种仅按照靶点卵白的布局信，卵白质上的位点进行针对性的设想该方式能够对医治和诊断中各类，泛的用处具有广。

　　U计较和深度进修在药物发觉中的变化作Nat Mach Intell｜GP用

　　28日7月，old2预测出2.14亿个卵白质布局DeepMind官宣：AlphaF，所有已知卵白质几乎涵盖地球上。

　　 Dauparas作者Justas，nikov组一路摸索共进化和图收集的关系在哈佛大学和Sergey Ovchin，avid Baker课题组随后插手了卵白质设想大师D。于图扩散模子MPNN基，白质布局的理解而且插手了对蛋，融入到了神经收集之中将卵白质布局消息的，复率提高到了50%从而卵白质序列的回。

　　. Dror传授组针对配体生成问题斯坦福大学计较机科学系Ron O，络和3D原子点云表征进行建模利用数据无效的E(3)等变网。D空间消息同时生成合理的分子该方式能连系卵白质口袋的3，物发觉过程从而加快药。该框架确实能生成可行的分子通过对多种性质进行评估证明。

　　NAS杂志上在3月的P，工学院结合颁发论文清华大学与麻省理。对 COVID-19 的抗体科学家描述了点窜一种已知的针，种疾病变体的功能以提高其针对多。haFold 2团队参考了Alp，了其方式而且采用，pMind的代码但没有利用Dee。

　　年8月2日2022，一篇简短的评论文章Nature颁发了，ld的手艺成绩出发从AlphaFo，AI的全数潜力会商了若何实现。：为了充实操纵人工智能文章提到了两个主要概念，必需自在共享数据和软件，究人员必需合作无懈计较、理论和尝试研。

　　白质布局打分、卵白质布局预测数据集 PSP等环节手艺包含AI MSA 引擎、卵白质折叠锻炼推理流程、蛋， MindSpore 社区开源相关代码和模子参数后续会在昇思。

　　模子、临床数据三大抢手范畴本文按照卵白质布局、算法，的主要论文进行梳理对2022年以来，为生物医药带来的改变与列位配合回首AI。

　　phaFold2发生的数据Facebook操纵Al，seq2seq的模子采用几何不变处置层的，实现了51%的序列复此刻卵白质骨架布局数据上，复现率达到72%对于包埋残基的，法提高了近10%总体上比现无方。

　　29日3月，ug Discov Today杂志颁发文章赛诺菲的NikhilPillai等人在Dr，前小分子药物发觉中的多种使用阐发和反思了机械进修在临床，使命中的分子表征方式并简要引见了机械进修。

　　8日4月，Communications 上颁发文章：摸索了迁徙进修和可注释性进修中的暗示哥本哈根大学计较机科学系 Wouter Boomsma 等人在 Nature 。

　　祥传授的科研团队来自湖南大学曾湘，伊利诺伊大学芝加哥分校Philip Yu传授等多位学者合作与弗雷德里克国度癌症研究所Ruth Nussinov传授、，进行药物重定位主题的综述文章颁发了操纵深度进修方式和东西。

　　16日5月，uo等人在J Chem Inf Model杂志颁发文章麻省理工学院计较机科学与人工智能尝试室的Jiang G，中提取反映的主动化方式引见了一种从化学文献。布局预测问题将其表述为，构成的两个阶段的深度进修架构来处理并通过一个由产品提取和反映脚色标识表记标帜。

　　立异核心团队、深圳湾尝试室高毅勤教讲课题组华为与北京昌平尝试室、北京大学生物医学前沿，东西 MEGA-Protein结合推出全流程卵白质布局预测。

　　军研究尝试室（AFRL）等机构的研究人员合作劳伦斯伯克利国度尝试室（LBNL）、美国空，、挑战以及潜力与前景进行了较为系统的阐述对人工智能在合成生物学中的使用现状、影响。 for Synthetic Biology为题以Artificial Intelligence，ations of the ACM》于本年5月发布在《Communic。

　　的Python库上CKG成立在科学，er、graphdb connector等四个独立的功能模块包罗analytic score、graphdb build。本的互动摸索中实现可反复、可再现和通明的阐发它能够在尺度工作流程和基于Jupyter笔记。是开源的整个系统，MIT许可并取得了，在Nature上相关引见已颁发。

　　16日2月，lexander Tropshab等人颁发文章美国北卡罗来纳大学Eshelman药学院的A， (COP)的概念提出了临床成果路径，果的一系列环节的分子和细胞事务将其定义为相关药物分子医治效。医学学问图谱进行计较阐释COP能够通过挖掘生物，物发觉和再操纵的假设铺平道路这为发生新的、有指点意义的药。

　　台 REINVENT 中实施课程进修阿斯利康公司的研究人员在从头设想平，性的申明性分子设想问题并将其使用于分歧复杂。略的强化进修比拟与尺度的基于策，和输出质量的积极影响成果显示了对加快进修。achine Intelligence研究于6月22日发布在Nature M。

　　-配体复合物的几何深度进修Stanford 基于卵白，段的配体生指点基于片成

　　2年6月202，展了一种从头设想算法AutoDesigner薛定谔公司的Sathesh Bhat等人发，的先导化合物优化思绪通过仿照药物化学家，动性质前提的化学空间普遍地摸索合适优良药，且具有抱负活性的化合物最终设想出新鲜、类药，酶（DAO）抑止剂的设想项目傍边并将其成功使用在D-氨基酸氧化。. Chem. Inf. Model.上功效已颁发在美国化学会出书的焦点期刊J。

　　26日2月，n Gaston-Mathé等人的一项晚期工作：基于DL的从头设想算法J Comput Chem杂志颁发了AI药物发觉公司Iktos的Yan，AR模子连系QS，标上都具有活性的虚拟化合物生成了150个估计在所有指，被合成和测试11个化合物。

　　21日7月，Baker等人在Science颁发文章华盛顿大学卵白质设想研究所David ，设想含有事后指定的功能位点的卵白质描述了若何采用两种深度进修方式来，eTTAFold收集通过特地锻炼的Ros，一个可行的卵白质骨架在单次向前传送中建立。

　　用生物医学学问图谱阐释药物的临床成果路Drug Discov Today｜径

　　old2为根本以AlphaF，等人提拔了卵白复合物预测的能力Patrick Bryant， Communication上该工作于近日颁发在Nature。构预测中的MSA输入作者优化了复合物结，复合物布局预测能力大幅提拔了AF2的，以很好地分类卵白能否能彼此感化而且成长的pDockQ目标可。

　　9日5月，合倡议了一项名为“未充实研究的卵白质打算”的查询拜访Georg Kustatscher等六国科学家联。

　　物消息学和药物基因组学数据库概述了常用于药物重定位的生；及最先辈的基于深度进修的方式及将来挑战并会商了基于序列和基于图的暗示进修方式。